El Programa Desarrollo Sistémico del Pensamiento en el Sistema Atitlán, es una iniciativa que pretende incidir significativamente en el mejoramiento de la calidad educativa, mediante la implementación de metodologías innovadoras, que han sido validadas y respaldadas por especialistas en educación (David Perkins, Edward de Bono, Reuven Feuerstein, Robert Sternberg, Richard Nickerson, Margarita de Sánchez,
entre otros.) e instituciones de reconocimiento mundial (Universidad de Harvard y Universidad de Yale de EE.UU., Universidad Simón Bolívar y Universidad Metropolitana de Venezuela, Instituto Tecnológico de Monterrey de México) y aplicadas exitosamente en varios países de América Latina y África del Sur.
Adicionalmente se proyecta la creación de un subprograma estimulación adecuada que involucra a los niños que están en edad preescolar y sus familiares; y otro que garantice la aplicación del Currículo Nacional Base (CNB) en las aulas.
Para el logro de los objetivos de este programa es indispensable involucrar a los padres y madres de familia, es por eso que se contempla la creación de una “Escuela para Padres” en cada centro educativo participante.